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Sites de phosphorylation et d'ancrage de phosphatidyl inositol |
Sites probables de phosphorylation et d'ancrage de phosphatidylinositol glycosylé Une analyse à l'aide des base de données PROSITE (http://ca.expasy.org/tools/scanprosite/), Pfam et Smart (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi) n'ayant donnée aucun résultat, une prédiction des sites probables de phosphorylation de la protéines TaCOR413-PM1 a été conduite en utilisant le programme à base de réseaux de neurones NetPhos (http://www.cbs.dtu.dk). Bien que la protéine contienne huit résidus Ser, dix Thr et quatre Tyr, NetPhos ne prédit la phosphorylation que d'une seule Thr (figures 5 et 6). Il est intéressant de noter que dans les deux modèles de la figure 5, ce site de phosphorylation est situé à la face interne de la membrane, là où il peut être la cible de protéines kinases intracellulaires.
Figure 6. Résidus thréonine conservés et potentiellement phosphorylés chez les membres de la famille des protéines COR413-PM1, tel que prédit par NetPhos. Une prédiction à l'aide du programme DGPI (http://129.194.186.123/GPI-anchor/index_en.html), a permis de trouver un site d'ancrage de phosphatidylinositols glycosylés (GPI) en partie C-terminale de toutes les protéines COR413-PM. Cette deuxième modification pots-traductionnelle s'imisce bien dans les analyses structurelles précédentes parce que les ancres GPI sont situées sur la face externe de la membrane (figure 5). |