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Introduction Sites de phosphorylation et d'ancrage de phosphatidyl inositol |
Introduction Afin de déterminer les fonctions de nouvelles protéines, une combinaison des profils d'expression et d'analyses bioinformatiques peut-être utilisée. Dans le cas d'études portant sur la tolérance au gel et à la vernalisation de cultivars de blé, lorsque l'expression d'un nouveau gène est corrélée à la capacité de résistance, il est probable que celui-ci code pour une protéine jouant probablement un rôle dans ce phénomène. Ainsi, l'analyse de l'expression différentielle intra ou interspécifique représente une puissante méthode à la recherche de ces gènes impliqués dans la tolérance aux stress abiotiques. Lors d'études antérieures (Danyluk, 1996), il a été démontré que la variété printanière de blé ne maintien pas une expression maximale des gènes cor413 et que cette expression différentielle est associée à leur faible degré de tolérance au gel. Afin de caractériser les protéines codées par ces gènes, les séquences de celles-ci ont été analysées en utilisant divers outils bioinformatiques. Ceux-ci ont entre autres servi à identifier les signaux de triage, déterminer les modifications posttraductionnelles conservées, ainsi que les régions transmembranaires et les structures secondaires et tertiaires. Les outils utilisées faisaient appel aux plus récents algorithmes d'apprentissage machine, sous la forme de réseaux de neurones et de modèles de Markov cachés. Ils ont permis l'identification d'importants domaines fonctionnels qui seront étudiés lors de recherches ultérieures. Le présent travail se concentre plus sur les outils bioinformatiques et leurs résultats que sur les aspects biologiques, afin de mieux respecter le cadre bioinformatique du cours. |