Domaines transmembranaires

 

Des tracés de Kyte et Doolittle générés par Protscale (http://ca.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl) démontrent des patrons hydrophobes avec six pics clairement identifiés. Une superposition des patrons pour les quinze membres séquencés des membres de COR413-PM indique que l'hydrophobicité de ces régions est conservée parmis ceux-ci (figure 4A). Afin de procéder à une analyse topologique plus fine de la structure transmembranaire des COR413-PM, le programme TMHMM a été utilisé (figure 4B). Les prédictions indiquent clairement la présence de cinq domaines transmembranaires.

 

Figure 4. Hydropathie et prédictions des domaines transmembranaires. Compilation des patrons A) Kyte et Doolittle et B) TMHMM pour les membres de la famille COR413. S1 à S6, pics 1 à 6. TM1 à 5, régions transmembranaires 1 à 6.