Début

Introduction

Identification des homologues

Localisation intracellulaire

Domaines transmembranaires

Modèles structuraux

Sites de phosphorylation et d'ancrage de phosphatidyl inositol

Discussion

Matériel supplémentaire

Bibliographie

Modèles structuraux

Les analyses précédentes ont conduits à l'émergence de deux modèles structuraux pour les membres des protéines COR413-PM (figure 5). Dans le premier, les protéines auraient cinq domaines transmembranaires, avec la région N-terminale à l'extérieur de la cellule, tandis que la région C-terminale serait dans le cytoplasme. Le modèle alternatif propose plutôt la présence de six domaines transmembranaires avec les régions N et C-terminale dans la cellule. La principale différence est topologie inversée de la première moitié de la protéine.

Il a été impossible de produire une topologie pour les membres de la famille COR413-TM. En effet, malgré les prédictions d'hydrophobicité, TMHMM ne pouvait généré de prédictions claires. Ce qui rendait impossible une détermination des régions des protéines exposées aux parties luminale et stromale du thylakoïde.

Figure 5. Modèles proposés pour les protéines COR413-PM. Les régions vertes représentent les domaines transmembranaires. Les régions bleues représentent les parties conservées avec les protéines COR413-TM. Les régions S1 à S6 correspondent aux pics des patrons Kyte et Doolittle. La région en rouge est un site de phosphorylation potentiel. La ligne rose est un site prédit d'ancrage de lipide. La ligne orange est la position du motif conservé DRT.